Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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