Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN3Q16667 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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