Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms