Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1EQ15878 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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