Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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