Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITSN1Q15811 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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