Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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