Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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