Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDGFRLQ15198 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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