Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HERPUD1Q15011 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HERPUD1Q15011 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HERPUD1Q15011 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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