Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GAPVD1Q14C86 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
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