Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD4Q14839 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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CHD4Q14839 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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