Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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