Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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