Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VGLL4Q14135 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms