Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CKAP5Q14008 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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