Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGRF1Q13972 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms