Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms