Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CAPSQ13938 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CAPSQ13938 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CAPSQ13938 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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CAPSQ13938 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CAPSQ13938 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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