Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PKP1Q13835 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PKP1Q13835 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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