Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ITGA9Q13797 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ITGA9Q13797 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ITGA9Q13797 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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ITGA9Q13797 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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ITGA9Q13797 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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