Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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APOFQ13790 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOFQ13790 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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