Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms