Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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