Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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