Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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