Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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