Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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