Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL28Q13084 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms