Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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