Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms