Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP1Q12981 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms