Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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TRAF2Q12933 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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