Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPN13Q12923 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPN13Q12923 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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