Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.35□□□□□ -1.711e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.335e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.475e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.555e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.068e-8■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.01□□□□□ -1.771e-323■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 NPRL3-204ENST00000456528 794 ntTSL 514.24□□□□□ -0.133e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-206ENST00000440343 368 ntTSL 1 (best)27.26■■□□□ 1.952e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-204ENST00000415785 531 ntTSL 415.81■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 214.47□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 PPARA-211ENST00000496865 449 ntTSL 33.37□□□□□ -1.872e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.844e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.334e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.344e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 518.42■□□□□ 0.545e-10■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-10■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-10■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.517e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 RALGAPA1-210ENST00000554704 2698 ntTSL 26.67□□□□□ -1.344e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 RALGAPA1-209ENST00000554652 4487 ntTSL 25.17□□□□□ -1.584e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.262e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-215ENST00000575186 578 ntTSL 421.24■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 TNFRSF10B-204ENST00000519028 612 ntTSL 220.22■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-209ENST00000535194 710 ntTSL 319.08■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-205ENST00000570423 568 ntTSL 419.03■□□□□ 0.642e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-216ENST00000554228 2555 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-211ENST00000573085 484 ntTSL 416.75■□□□□ 0.272e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-207ENST00000572156 710 ntTSL 515.66■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-213ENST00000574683 588 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-218ENST00000576591 565 ntTSL 414.49□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-210ENST00000537046 875 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 KLC1-220ENST00000555856 535 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-213ENST00000553325 976 ntTSL 29.81□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 AKAP1-216ENST00000575322 650 ntTSL 46.63□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-216ENST00000556000 2092 ntTSL 1 (best)5.04□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 ZC3H14-217ENST00000556110 400 ntTSL 32.44□□□□□ -2.022e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-12■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KANSL1-209ENST00000574655 1681 ntTSL 515.76■□□□□ 0.111e-12■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KANSL1-222ENST00000639099 1724 ntTSL 515.3■□□□□ 0.041e-12■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.426e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.416e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.426e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.496e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.656e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-217ENST00000477394 816 ntTSL 59.14□□□□□ -0.956e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-215ENST00000475056 682 ntTSL 34.52□□□□□ -1.696e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-207ENST00000463295 607 ntTSL 54.31□□□□□ -1.726e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 DAP3-220ENST00000490249 710 ntTSL 33.29□□□□□ -1.886e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.951e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 UCP2-208ENST00000544615 1004 ntTSL 29.91□□□□□ -0.822e-55■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-207ENST00000572346 567 ntTSL 414.73□□□□□ -0.051e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-213ENST00000573519 654 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-206ENST00000571714 676 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-219ENST00000576713 571 ntTSL 59.29□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 49.14□□□□□ -0.951e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 NPLOC4-211ENST00000573212 564 ntTSL 48.07□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 XIST-202ENST00000417942 724 ntTSL 36.31□□□□□ -1.41e-9■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.591e-9■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 XIST-203ENST00000421322 446 ntTSL 22.73□□□□□ -1.971e-9■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KIF2C-205ENST00000455186 908 ntTSL 510.45□□□□□ -0.746e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KIF2C-204ENST00000452259 1124 ntTSL 58.16□□□□□ -1.16e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 56.07□□□□□ -1.446e-8■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.196e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)24.63■■□□□ 1.536e-6■□□□□ 10.2
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