Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFEMP1Q12805 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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