Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms