Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EP300Q09472 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms