Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNA1Q09470 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms