Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms