Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD47Q08722 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD47Q08722 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms