Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CD164Q04900 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms