Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC6Q03468 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms