Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BDH1Q02338 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BDH1Q02338 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms