Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms