Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLCB3Q01970 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLCB3Q01970 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLCB3Q01970 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms