Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms