Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRX6P78412 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX6P78412 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms