Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-24P63145 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-24P63145 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms