Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UFM1P61960 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
UFM1P61960 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms